超低双胞率、高重复性、全转录组捕获……VITA系列产品的优秀性能远超想象

M20 Genomics于2022年推出的VITA产品系列，在各方面性能都较为优越，且基于随机引物原理带来的无物种限制、无样本类型限制、全长捕获的优点，已成为许多科研人员做单细胞实验的第一选择。

但对于还未使用VITA系列产品的科研人员来说，平台性能是他们最关心的要素之一。今天我们就来看看，VITA产品系列的平台性能，到底有多优秀：

01-双胞率

单细胞测序中为了在单细胞水平上区分种群时，我们期望每个barcode标签下只有一个真实的细胞。但实际实验中由于泊松分布，会出现两个或多个细胞共用一个barcode的情况，这种情况的概率为双胞率。双胞显然是不可取的，因为其可能错误暗示实际上并不存在的中间种群或过渡状态，因此双胞率为单细胞平台重要的性能参数。

我们使用人鼠混合细胞系评估VITA平台双胞率。捕获总细胞数为2250、4085、5285、18638的情况下，双胞率分别为0.31%、0.37%、0.34%、1.05%（图1）。VITA平台不仅双胞率性能表现优异；且随着捕获细胞数增加，双胞率能稳定保持较低水平。

图1. VITA平台双胞率

02-重复性

科学实验作为检验理论、验证事实、发现知识的重要方法和工具，实验可重复性是科学研究真实性和确定性的基础。对同一肝癌FFPE样本进行2次重复实验，通过UMAP降维聚类分析，获得分群结果一致（图2），显示VITA平台均有较好的可重复性，可以进行大规模的单细胞转录组检测。

图2.同一样本进行2次VITA平台检测的UMAP分析

03-全转录组

VITA平台基于随机引物原理可进行全转录组捕获，不仅可以捕获mRNA，还可以捕获非编码RNA，如lncRNA，miRNA，snRNA等（图3）。非编码RNA广泛参与生命活动中重要的生物功能，如生物个体的发育与分化、生殖、细胞凋亡和细胞重编程等，并且参与调控一系列的心血管疾病、肿瘤、代谢性疾病、感染免疫性疾病等。研究人员基于VITA平台可开展单细胞非编码RNA研究（图4），从更多维度解析数据、挖掘生物学现象的机制，推进人类医学进步。

图3.VITA平台捕获RNA类型：A.新鲜样本；B.冻存样本；C.FFPE样本

图4.基于lncRNA进行UMAP分析以及Marker gene分析

从上面的结果可以看出，VITA产品系列的双胞率低于2%、重复性高、可实现全转录组捕获，能够检测到lncRNA，miRNA，snRNA等，是一款基础性能非常优秀的单细胞测序平台，可以为科研人员提供更准确的研究数据。当前，我们的产品已面向市场供应多时，与国内的各大服务商都进行了合作，想要体验这款优秀产品的科研小伙伴们，快快行动起来吧～