跃真生物
  • Q 对于细菌的形状、直径大小是否有限制要求?
    A

    没有限制要求,细菌的直径一般在0.5~10μm之间,均符合检测条件。

  • Q 单菌的标准是什么,如果一个细菌物种的不同菌株混合,算单菌吗?
    A

    此处单菌指种水平的一个细菌物种。

  • Q 粪便样本制备单细菌悬液需要富集培养吗?
    A

    粪便样本前处理:加入PBST(含RNA酶抑制剂)涡旋混匀后过滤去除杂质,上清液高速离心,取微生物沉淀进行后续固定。无需富集培养。

  • Q 需捕获多少细菌进行测序分析,测序量要求多少?
    A

    单菌细胞数:2000-3000,测序量30-60G;

    混菌细胞数:5000-10000,测序量150-300G。

  • Q rRNA占比高的问题怎么解决?
    A

    RNA比例相对较高仅造成数据量的损耗。细菌核酸量较少,增加测序量可以获得足够的基因进行后续分析。

  • Q 和细菌bulk RNAseq相比,单细菌转录组有什么优势?
    A

    可研究细菌表达水平的异质性,揭示平均值掩盖的差异。

  • Q 野生株和点突变改造后的突变株,能检测出的转录水平的差异吗?
    A

    只要有表达差异,可以检出。

  • Q MscRNA-seq能反映细菌丰度吗?与宏转录组测出来的结果一致性如何?
    A

    可以反映细菌丰度,与宏转录组稍有差异,优势物种相似。

  • Q 进行单细菌转录组功能分析,需要参考基因组吗?
    A

    需要。

  • Q 可以做2种细菌的互作研究吗?
    A

    可以,目前已实现了多菌互作的测试。

  • Q 细菌亚群鉴定后,还需要做功能验证吗?
    A

    根据研究目的可进行功能验证,如构建荧光报告菌株、流式分选等。

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